人工智能正解放化學(xué)家的雙手
近日,香山科學(xué)會(huì)議聚焦綠色生態(tài)與化學(xué)化工,除了各種前沿化學(xué)化工技術(shù)之外,人工智能在該領(lǐng)域的應(yīng)用成為被關(guān)注的新議題。
“合成化學(xué)過(guò)程中的變數(shù)太多確實(shí)給通量制備和通量反應(yīng)條件篩選增加了難度。但是在大數(shù)據(jù)與人工智能時(shí)代,這樣的狀況將會(huì)大大改變。”中科院上海有機(jī)化學(xué)研究所副所長(zhǎng)馬大為在會(huì)議上介紹,人工智能有望助力合成化學(xué)研究邁上新的臺(tái)階。
“勞動(dòng)密集型”將成過(guò)去
“在有機(jī)合成領(lǐng)域,合成化學(xué)家在上個(gè)世紀(jì)就號(hào)稱(chēng)給予足夠的學(xué)生和經(jīng)費(fèi)資助,可以合成任何復(fù)雜的有機(jī)小分子。但是直到今天,無(wú)論是新藥開(kāi)發(fā)還是新材料發(fā)展,人們發(fā)現(xiàn)過(guò)程的決速步驟往往還是化合物的合成。”馬大為介紹。
馬大為解釋說(shuō),這是因?yàn),盡管化合物性質(zhì)的評(píng)估大部分已進(jìn)入通量篩選階段,但化學(xué)合成仍然停留在手工操作階段。
在化學(xué)合成領(lǐng)域,由于不同化學(xué)反應(yīng)條件下的無(wú)窮變化,研究人員設(shè)計(jì)化學(xué)合成路線(xiàn)基本上還是依靠手工——在藥物分子合成領(lǐng)域尤其突出。這就讓化學(xué)合成更像一種“勞動(dòng)密集型”工作。
但在人工智能時(shí)代,這種狀況將逐漸成為過(guò)去;诖髷(shù)據(jù)與人工智能的計(jì)算機(jī)程序在輔助研究人員進(jìn)行化學(xué)合成路線(xiàn)設(shè)計(jì)方面開(kāi)始變得越來(lái)越成熟實(shí)用。
去年4月,一個(gè)德國(guó)研究團(tuán)隊(duì)在《自然》期刊發(fā)表論文稱(chēng),他們可以憑借人工智能系統(tǒng)以前所未有的速率進(jìn)行化學(xué)合成分析,這將大大提升科研人員研發(fā)新藥和其他化合物的效率。
根據(jù)這篇論文的內(nèi)容,研究人員利用人工智能系統(tǒng)設(shè)計(jì)一個(gè)分子的合成路線(xiàn),只需要5秒鐘。馬大為感嘆說(shuō),人工去設(shè)計(jì)的話(huà),5秒鐘都來(lái)不及把分子結(jié)構(gòu)看清楚,5分鐘都不一定能把分子設(shè)計(jì)出來(lái)。
南京大學(xué)化學(xué)化工學(xué)院副教授李承輝了解到人工智能算法推薦分子的合成路線(xiàn)后,獲得不少啟發(fā)。他目前也在考慮如何用人工智能幫助他做化學(xué)研究。
李承輝前不久發(fā)現(xiàn)一種新的分子內(nèi)成環(huán)反應(yīng),希望了解這種反應(yīng)是否在其他分子內(nèi)也存在。按照以前的研究方式,他的工作量會(huì)非常大。因?yàn)橐獧z測(cè)這種反應(yīng)是否具有普適性,需要用不同的分子做大量的實(shí)驗(yàn)才行。“如果有人工智能的幫助,就可以有針對(duì)性地去做這件事! 李承輝說(shuō)。
開(kāi)始扮演得力助手
“小通量的反應(yīng)條件篩選設(shè)備已經(jīng)在一些公司和大學(xué)變成常規(guī)武器,大通量的大型反應(yīng)矩陣機(jī)器人已經(jīng)誕生。”馬大為認(rèn)為,這些設(shè)備的普及化有可能為將來(lái)的合成化學(xué)研究帶來(lái)巨大變化,在很大程度上解放了合成化學(xué)家的雙手,讓研究人員花更多的時(shí)間進(jìn)行數(shù)據(jù)分析和反應(yīng)的頂層設(shè)計(jì)。
馬大為在接受記者采訪(fǎng)時(shí)介紹,人工智能程序用于預(yù)測(cè)普通的化學(xué)小分子合成路線(xiàn)已趨于成熟。即使一些復(fù)雜的有機(jī)小分子比如藥物分子,由于結(jié)構(gòu)單元比較單一,合成反應(yīng)并不是很多,人工智能程序可以直接輔助設(shè)計(jì)出合成路線(xiàn)。這對(duì)于初級(jí)的研究人員而言,會(huì)提供很大幫助。
“現(xiàn)在做藥物合成研究,假如知道一個(gè)藥物分子的結(jié)構(gòu),人工智能系統(tǒng)可以根據(jù)它的結(jié)構(gòu)分析出很多種合成路線(xiàn),并且推薦一個(gè)最佳路線(xiàn)!崩畛休x說(shuō),如果是以前,這樣的研究需要非常有經(jīng)驗(yàn)的有機(jī)化學(xué)專(zhuān)家才能實(shí)現(xiàn),但是將來(lái)在人工智能的幫助下,從事無(wú)機(jī)化學(xué)的研究人員也可以做到。
而在合成結(jié)構(gòu)比較復(fù)雜的目標(biāo)分子時(shí),比如需要20多個(gè)步驟才能合成出來(lái)的天然界存在的復(fù)雜分子,人工智能程序可以預(yù)測(cè)出很多條不同的路線(xiàn)。
“研究人員可能只能想出20多個(gè)合成路線(xiàn),而這些程序可能會(huì)提供上百條可能的合成路線(xiàn),這對(duì)于研究人員來(lái)說(shuō)非常有幫助,因?yàn)橛行┞肪(xiàn)可能從未想過(guò)!瘪R大為說(shuō)。
馬大為告訴記者,根據(jù)人工智能程序提供的預(yù)測(cè)路線(xiàn),有經(jīng)驗(yàn)的研究人員可以從中判斷出哪些路線(xiàn)是好的,哪些是有提示意義的,進(jìn)而幫助研究人員思考一些問(wèn)題。這可以為化學(xué)合成提供更多的機(jī)會(huì)。因?yàn)楦鶕?jù)人工智能程序的提示,再加上人腦進(jìn)一步深度思考,可能會(huì)設(shè)計(jì)出更好的化學(xué)合成路線(xiàn)。

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